Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms