Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms