Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIEQ8NEW7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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TMIEQ8NEW7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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TMIEQ8NEW7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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