Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSAMQ8N6F7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms