Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD35Q8N283 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms