Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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