Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTU1Q7Z7A3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms