Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms