Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms