Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MFSD6Q6ZSS7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MFSD6Q6ZSS7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms