Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms