Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms