Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms