Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms