Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms