Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-203ENST00000562210 874 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 27.8
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PRPF8Q6P2Q9 MKL1-209ENST00000477468 524 ntTSL 27.69□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 27.8
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PRPF8Q6P2Q9 USP49-205ENST00000448078 480 ntTSL 35.22□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 27.8
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PRPF8Q6P2Q9 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TUBGCP3-203ENST00000462580 915 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DMXL2-212ENST00000560421 652 ntTSL 55.07□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-205ENST00000518981 1746 ntTSL 25.01□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 QRICH1-203ENST00000411682 359 ntTSL 54.97□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 24.94□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TAPT1-203ENST00000503858 526 ntTSL 24.75□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 LARP1B-205ENST00000506199 1412 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-202ENST00000561469 577 ntTSL 34.67□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MANF-203ENST00000482262 436 ntTSL 24.66□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 24.64□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 27.8
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