Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms