Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VIRMAQ69YN4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms