Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms