Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf135Q5VTT2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf135Q5VTT2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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