Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms