Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PDZK1Q5T2W1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PDZK1Q5T2W1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PDZK1Q5T2W1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PDZK1Q5T2W1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PDZK1Q5T2W1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PDZK1Q5T2W1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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