Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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