Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms