Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms