Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms