Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM176BQ3YBM2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM176BQ3YBM2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM176BQ3YBM2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM176BQ3YBM2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM176BQ3YBM2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM176BQ3YBM2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms