Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms