Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms