Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms