Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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