Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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