Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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