Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TAF1AQ15573 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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