Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms