Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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