Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms