Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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