Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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