Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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