Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms