Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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