Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSTA3Q13630 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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