Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms