Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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