Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms