Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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