Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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