Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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