Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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